MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 1466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	GAG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014957	GAG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014957	GAG	2	6	39	44	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014957	GAG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014957	TGTT	2	8	127	134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014957	G	6	6	151	156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014957	ACGAG	2	10	157	166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014957	GC	4	8	240	247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014957	GTG	2	6	248	253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014957	GAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041923
11	NC_014957	TCGGT	2	10	367	376	0 %	40 %	40 %	20 %	320041923
12	NC_014957	TGC	2	6	466	471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
13	NC_014957	GCG	3	9	523	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
14	NC_014957	C	7	7	546	552	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
15	NC_014957	CCG	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
16	NC_014957	CCCGGC	2	12	714	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
17	NC_014957	GAG	2	6	744	749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
18	NC_014957	GC	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
19	NC_014957	CGA	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
20	NC_014957	GCCG	2	8	837	844	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
21	NC_014957	CTG	3	9	888	896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
22	NC_014957	CGCC	2	8	920	927	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
23	NC_014957	CGCCC	2	10	1031	1040	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
24	NC_014957	AG	3	6	1060	1065	50 %	0 %	50 %	0 %	320041923
25	NC_014957	GACG	2	8	1089	1096	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
26	NC_014957	CGG	2	6	1097	1102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
27	NC_014957	GTG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041923
28	NC_014957	CCG	3	9	1149	1157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
29	NC_014957	GTG	3	9	1298	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041923
30	NC_014957	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
31	NC_014957	CGC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
32	NC_014957	CCGC	2	8	1417	1424	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
33	NC_014957	TCT	3	9	1429	1437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320041923
34	NC_014957	CCG	3	9	1438	1446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
35	NC_014957	AGC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
36	NC_014957	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041923
37	NC_014957	GGTGAT	2	12	1586	1597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	320041923
38	NC_014957	GCCA	2	8	1611	1618	25 %	0 %	25 %	50 %	320041923
39	NC_014957	CGT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
40	NC_014957	AAC	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041923
41	NC_014957	GCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
42	NC_014957	TGC	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
43	NC_014957	CTGC	2	8	1919	1926	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
44	NC_014957	CCG	2	6	2016	2021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
45	NC_014957	GC	3	6	2040	2045	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
46	NC_014957	AGG	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
47	NC_014957	CGC	2	6	2163	2168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
48	NC_014957	CG	3	6	2187	2192	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
49	NC_014957	TCC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041923
50	NC_014957	GTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041923
51	NC_014957	GCC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
52	NC_014957	CAC	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
53	NC_014957	CCG	4	12	2368	2379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
54	NC_014957	GCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
55	NC_014957	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
56	NC_014957	CCG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
57	NC_014957	CGA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
58	NC_014957	CG	3	6	2579	2584	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
59	NC_014957	CGCT	2	8	2601	2608	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
60	NC_014957	GA	3	6	2636	2641	50 %	0 %	50 %	0 %	320041923
61	NC_014957	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041923
62	NC_014957	CGA	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
63	NC_014957	CGCC	2	8	2762	2769	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
64	NC_014957	C	6	6	2783	2788	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
65	NC_014957	GCC	2	6	2808	2813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
66	NC_014957	CTG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041923
67	NC_014957	TCC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041923
68	NC_014957	GGC	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041923
69	NC_014957	ACGG	2	8	3007	3014	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
70	NC_014957	CGCC	2	8	3020	3027	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
71	NC_014957	ACGCC	2	10	3041	3050	20 %	0 %	20 %	60 %	320041923
72	NC_014957	GCC	4	12	3048	3059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
73	NC_014957	ACC	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
74	NC_014957	CCCGG	2	10	3098	3107	0 %	0 %	40 %	60 %	320041923
75	NC_014957	CCGC	2	8	3112	3119	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
76	NC_014957	GGTC	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	320041923
77	NC_014957	GAC	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
78	NC_014957	CGA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041923
79	NC_014957	CCA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041923
80	NC_014957	GCTCCG	2	12	3290	3301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320041923
81	NC_014957	CGCCCT	2	12	3302	3313	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041923
82	NC_014957	CGCCC	2	10	3324	3333	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
83	NC_014957	CCGC	2	8	3343	3350	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
84	NC_014957	C	8	8	3370	3377	0 %	0 %	0 %	100 %	320041923
85	NC_014957	CCCTCC	2	12	3418	3429	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320041923
86	NC_014957	T	8	8	3468	3475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014957	ACC	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014957	ACC	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014957	CGT	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014957	AAC	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014957	AAGC	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014957	CTT	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014957	CTC	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041924
94	NC_014957	ATGCG	2	10	3730	3739	20 %	20 %	40 %	20 %	320041924
95	NC_014957	GGTC	2	8	3752	3759	0 %	25 %	50 %	25 %	320041924
96	NC_014957	CA	4	8	3793	3800	50 %	0 %	0 %	50 %	320041924
97	NC_014957	ACATG	2	10	3801	3810	40 %	20 %	20 %	20 %	320041924
98	NC_014957	GAA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041924
99	NC_014957	CATC	2	8	3905	3912	25 %	25 %	0 %	50 %	320041924
100	NC_014957	TGG	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041925
101	NC_014957	TTGTGT	2	12	4003	4014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041925
102	NC_014957	TCGC	2	8	4031	4038	0 %	25 %	25 %	50 %	320041925
103	NC_014957	CCG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041925
104	NC_014957	TGA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041925
105	NC_014957	CTGAT	2	10	4116	4125	20 %	40 %	20 %	20 %	320041925
106	NC_014957	CT	3	6	4182	4187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014957	AGTG	2	8	4248	4255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014957	ATGGG	2	10	4278	4287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014957	GAAG	2	8	4295	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014957	TGT	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014957	GGAAG	2	10	4348	4357	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014957	GGC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014957	GCG	2	6	4376	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014957	ATCG	2	8	4426	4433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014957	GTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014957	TCC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014957	CCT	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014957	GGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014957	CGAAT	2	10	4511	4520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014957	TGG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014957	GGCCG	2	10	4669	4678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014957	TGC	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014957	GAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014957	GTTC	2	8	4719	4726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014957	ATCGA	2	10	4737	4746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014957	GACG	2	8	4749	4756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014957	GCGGA	2	10	4788	4797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014957	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014957	GATGA	2	10	4859	4868	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014957	GC	3	6	4883	4888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014957	GTCGC	2	10	4933	4942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014957	GGAAA	2	10	4966	4975	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014957	GTTCC	2	10	4989	4998	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014957	CATTC	2	10	5003	5012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014957	GAT	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014957	GTGAT	2	10	5132	5141	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014957	GTC	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014957	AACCG	2	10	5174	5183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014957	TGA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014957	T	8	8	5306	5313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014957	GAT	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014957	CTTG	2	8	5409	5416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014957	GTCAT	2	10	5458	5467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014957	CTCGT	2	10	5496	5505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014957	CTGGT	3	15	5506	5520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014957	GAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014957	GACG	2	8	5551	5558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014957	GGC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014957	CCGG	2	8	5575	5582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014957	C	7	7	5675	5681	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_014957	ATT	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014957	ACGG	2	8	5758	5765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014957	GGT	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
154	NC_014957	CCCG	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	320041926
155	NC_014957	TGG	2	6	6176	6181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
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157	NC_014957	CCTT	2	8	6213	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	320041926
158	NC_014957	GTG	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041926
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160	NC_014957	A	6	6	6548	6553	100 %	0 %	0 %	0 %	320041926
161	NC_014957	TGA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041926
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180	NC_014957	CGC	2	6	7435	7440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041926
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183	NC_014957	CCA	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041926
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185	NC_014957	CG	3	6	7574	7579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
186	NC_014957	ATC	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_014957	GTG	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014957	GTTGT	2	10	7725	7734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014957	CGCGG	2	10	7752	7761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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193	NC_014957	C	6	6	7846	7851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
194	NC_014957	ATG	2	6	7891	7896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_014957	CCCG	2	8	10529	10536	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
273	NC_014957	C	6	6	10545	10550	0 %	0 %	0 %	100 %	320041927
274	NC_014957	CG	3	6	10632	10637	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
275	NC_014957	TGG	2	6	10654	10659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041927
276	NC_014957	CGC	2	6	10667	10672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
277	NC_014957	AGC	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041927
278	NC_014957	C	6	6	10679	10684	0 %	0 %	0 %	100 %	320041927
279	NC_014957	CCT	2	6	10687	10692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041927
280	NC_014957	ACCC	2	8	10722	10729	25 %	0 %	0 %	75 %	320041927
281	NC_014957	CCG	2	6	10747	10752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
282	NC_014957	GTT	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041927
283	NC_014957	C	6	6	10786	10791	0 %	0 %	0 %	100 %	320041927
284	NC_014957	GCCG	2	8	10796	10803	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
285	NC_014957	CGTCAC	2	12	10848	10859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320041927
286	NC_014957	CGGCC	2	10	10920	10929	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
287	NC_014957	ATC	2	6	11020	11025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320041927
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290	NC_014957	GAG	2	6	11064	11069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041927
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292	NC_014957	CGCGC	2	10	11109	11118	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
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294	NC_014957	CGCGCC	2	12	11184	11195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
295	NC_014957	GCC	2	6	11291	11296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
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298	NC_014957	CG	3	6	11340	11345	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
299	NC_014957	TGC	2	6	11380	11385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041927
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311	NC_014957	CGA	2	6	11966	11971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041927
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324	NC_014957	GCCGCG	2	12	12445	12456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
325	NC_014957	CGG	2	6	12502	12507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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369	NC_014957	TGG	2	6	14773	14778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_014957	AG	3	6	14896	14901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
372	NC_014957	AAG	2	6	14902	14907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
373	NC_014957	C	6	6	14939	14944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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378	NC_014957	TCACC	2	10	15284	15293	20 %	20 %	0 %	60 %	320041929
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392	NC_014957	GCCCC	2	10	15682	15691	0 %	0 %	20 %	80 %	320041929
393	NC_014957	CCA	2	6	15719	15724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041929
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396	NC_014957	CGC	2	6	15805	15810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041929
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400	NC_014957	CCG	2	6	15927	15932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041929
401	NC_014957	CAG	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041929
402	NC_014957	GCC	3	9	16027	16035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041929
403	NC_014957	TTG	2	6	16088	16093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041929
404	NC_014957	TTC	2	6	16118	16123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_014957	TCG	2	6	16159	16164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_014957	CGC	2	6	16234	16239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041930
407	NC_014957	CGCTC	2	10	16243	16252	0 %	20 %	20 %	60 %	320041930
408	NC_014957	TCCCC	2	10	16333	16342	0 %	20 %	0 %	80 %	320041930
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411	NC_014957	TTC	2	6	16466	16471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_014957	TTC	2	6	16592	16597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_014957	TTC	2	6	16718	16723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_014957	ATG	2	6	18208	18213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
441	NC_014957	ATG	2	6	18222	18227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014957	TGG	3	9	18233	18241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014957	GGT	2	6	18273	18278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014957	GGA	2	6	18309	18314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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